Using Martin's simple example, I get the same results he does without explicitly declaring the namespace:

declare option output:method 'xml';
declare option output:indent 'yes';

<root><foo>bar</foo></root>

=>

<root>
  <foo>bar</foo>
</root>

Without the declaration, it's not indented:

<root><foo>bar</foo></root>

=>

<root><foo>bar</foo></root>

But the indentation is quite different from what I see in Saxon or oXygen output when I indent.  You see this with more complex examples.  For instance, here it is an excerpt for a book from the New Testament:

declare option output:method 'xml';
declare option output:indent 'yes';

/

=>

<book id="JHN">
    <sentence>
        <p>
            <milestone unit="verse" id="JHN 1:1">JHN 1:1</milestone> Ἐν ἀρχῇ ἦν ὁ Λόγος, καὶ ὁ Λόγος ἦν πρὸς τὸν Θεόν, καὶ Θεὸς ἦν ὁ Λόγος.</p>
        <wg>
            <wg role="g" class="group" xml:id="n430010010010170" rule="Conj3CL">
                <wg class="cl" xml:id="n430010010010050" head="true" rule="P-VC-S">
          <!--local:clause(), else-->
                    <wg role="p" class="pp" xml:id="n430010010010020" head="true" rule="PrepNp">
            <!--Role created from  pp2P-->
                        <w ref="JHN 1:1!1" after=" " class="prep" xml:id="n43001001001" lemma="ἐν" normalized="Ἐν" strong="1722" gloss="In [the]" domain="067002" ln="67.33" morph="PREP" unicode="Ἐν">Ἐν</w>
                        <wg class="np" xml:id="n430010010020011" head="true" rule="N2NP">
                            <w ref="JHN 1:1!2" after=" " class="noun" type="common" xml:id="n43001001002" lemma="ἀρχή" normalized="ἀρχῇ" strong="746" number="singular" gender="feminine" case="dative" head="true" gloss="beginning" domain="067003" ln="67.65" morph="N-DSF" unicode="ἀρχῇ">ἀρχῇ</w>
                        </wg>
                    </wg>
                    <wg role="vc" class="vp" xml:id="n430010010030011" rule="V2VP">
            <!--Role created from  vp2VC-->
                        <w ref="JHN 1:1!3" after=" " class="verb" xml:id="n43001001003" lemma="εἰμί" normalized="ἦν" strong="1510" number="singular" person="third" tense="imperfect" voice="active" mood="indicative" gloss="was" domain="013003" ln="13.69" morph="V-IAI-3S" unicode="ἦν">ἦν</w>
                    </wg>
                    <wg role="s" class="np" xml:id="n430010010040020" articular="true" rule="DetNP">
            <!--Role created from  Np2S-->
                        <w ref="JHN 1:1!4" after=" " class="det" xml:id="n43001001004" lemma="ὁ" normalized="ὁ" strong="3588" number="singular" gender="masculine" case="nominative" gloss="the" domain="092004" ln="92.24" morph="T-NSM" unicode="ὁ">ὁ</w>
                        <wg class="np" xml:id="n430010010050011" head="true" rule="N2NP">
                            <w ref="JHN 1:1!5" after="," class="noun" type="common" xml:id="n43001001005" lemma="λόγος" normalized="Λόγος" strong="3056" number="singular" gender="masculine" case="nominative" head="true" gloss="Word" domain="033006" ln="33.100" morph="N-NSM" unicode="Λόγος,">Λόγος</w>
                        </wg>
                    </wg>
                </wg>

With Saxon or oXygen, I get this:

<book id="JHN">
    <sentence>
        <p>
            <milestone unit="verse" id="JHN 1:1">JHN 1:1</milestone> Ἐν ἀρχῇ ἦν ὁ Λόγος, καὶ ὁ Λόγος ἦν πρὸς τὸν Θεόν, καὶ Θεὸς ἦν ὁ Λόγος.</p>
        <wg>
            <wg role="g" class="group" xml:id="n430010010010170" rule="conj3cl">
                <wg class="cl" xml:id="n430010010010050" head="true" rule="P-VC-S"><!--local:clause(), else-->
                    <wg role="p"
                        class="pp"
                        xml:id="n430010010010020"
                        head="true"
                        rule="PrepNp"><!--Role created from  pp2P-->
                        <w ref="JHN 1:1!1"
                           after=" "
                           class="prep"
                           xml:id="n43001001001"
                           lemma="ἐν"
                           normalized="Ἐν"
                           strong="1722"
                           gloss="In [the]"
                           domain="067002"
                           ln="67.33"
                           morph="PREP"
                           unicode="Ἐν">Ἐν</w>
                        <wg class="np" xml:id="n430010010020011" head="true" rule="N2NP">
                            <w ref="JHN 1:1!2"
                               after=" "
                               class="noun"
                               type="common"
                               xml:id="n43001001002"
                               lemma="ἀρχή"
                               normalized="ἀρχῇ"
                               strong="746"
                               number="singular"
                               gender="feminine"
                               case="dative"
                               head="true"
                               gloss="beginning"
                               domain="067003"
                               ln="67.65"
                               morph="N-DSF"
                               unicode="ἀρχῇ">ἀρχῇ</w>
                        </wg>
                    </wg>
                    <wg role="vc" class="vp" xml:id="n430010010030011" rule="V2VP"><!--Role created from  vp2VC-->
                        <w ref="JHN 1:1!3"
                           after=" "
                           class="verb"
                           xml:id="n43001001003"
                           lemma="εἰμί"
                           normalized="ἦν"
                           strong="1510"
                           number="singular"
                           person="third"
                           tense="imperfect"
                           voice="active"
                           mood="indicative"
                           gloss="was"
                           domain="013003"
                           ln="13.69"
                           morph="V-IAI-3S"
                           unicode="ἦν">ἦν</w>
                    </wg>
                    <wg role="s"
                        class="np"
                        xml:id="n430010010040020"
                        articular="true"
                        rule="DetNP"><!--Role created from  Np2S-->
                        <w ref="JHN 1:1!4"
                           after=" "
                           class="det"
                           xml:id="n43001001004"
                           lemma="ὁ"
                           normalized="ὁ"
                           strong="3588"
                           number="singular"
                           gender="masculine"
                           case="nominative"
                           gloss="the"
                           domain="092004"
                           ln="92.24"
                           morph="T-NSM"
                           unicode="ὁ">ὁ</w>
                        <wg class="np" xml:id="n430010010050011" head="true" rule="N2NP">
                            <w ref="JHN 1:1!5"
                               after=","
                               class="noun"
                               type="common"
                               xml:id="n43001001005"
                               lemma="λόγος"
                               normalized="Λόγος"
                               strong="3056"
                               number="singular"
                               gender="masculine"
                               case="nominative"
                               head="true"
                               gloss="Word"
                               domain="033006"
                               ln="33.100"
                               morph="N-NSM"
                               unicode="Λόγος,">Λόγος</w>
                        </wg>
                    </wg>
                </wg>
                <w ref="JHN 1:1!6"
                   after=" "
                   class="conj"
                   xml:id="n43001001006"
                   lemma="καί"
                   normalized="καί"
                   strong="2532"
                   gloss="and"
                   domain="089017"
                   ln="89.93"
                   morph="CONJ"
                   unicode="καὶ">καὶ</w>
                <wg class="cl"
                    xml:id="n430010010070060"
                    articular="true"
                    rule="S-VC-P"><!--local:clause(), else-->
                    <wg role="s"
                        class="np"
                        xml:id="n430010010070020"
                        articular="true"
                        rule="DetNP"><!--Role created from  Np2S-->
                        <w ref="JHN 1:1!7"
                           after=" "
                           class="det"
                           xml:id="n43001001007"
                           lemma="ὁ"
                           normalized="ὁ"
                           strong="3588"
                           number="singular"
                           gender="masculine"
                           case="nominative"
                           gloss="the"
                           domain="092004"
                           ln="92.24"
                           morph="T-NSM"
                           unicode="ὁ">ὁ</w>
                        <wg class="np" xml:id="n430010010080011" head="true" rule="N2NP">
                            <w ref="JHN 1:1!8"
                               after=" "
                               class="noun"
                               type="common"
                               xml:id="n43001001008"
                               lemma="λόγος"
                               normalized="Λόγος"
                               strong="3056"
                               number="singular"
                               gender="masculine"
                               case="nominative"
                               head="true"
                               gloss="Word"
                               domain="033006"
                               ln="33.100"
                               morph="N-NSM"
                               unicode="Λόγος">Λόγος</w>
                        </wg>
                    </wg>
                    <wg role="vc" class="vp" xml:id="n430010010090011" rule="V2VP"><!--Role created from  vp2VC-->
                        <w ref="JHN 1:1!9"
                           after=" "
                           class="verb"
                           xml:id="n43001001009"
                           lemma="εἰμί"
                           normalized="ἦν"
                           strong="1510"
                           number="singular"
                           person="third"
                           tense="imperfect"
                           voice="active"
                           mood="indicative"
                           gloss="was"
                           domain="085001"
                           ln="85.1"
                           morph="V-IAI-3S"
                           unicode="ἦν">ἦν</w>
                    </wg>
                    <wg role="p"
                        class="pp"
                        xml:id="n430010010100030"
                        articular="true"
                        head="true"
                        rule="PrepNp"><!--Role created from  pp2P-->
                        <w ref="JHN 1:1!10"
                           after=" "
                           class="prep"
                           xml:id="n43001001010"
                           lemma="πρός"
                           normalized="πρός"
                           strong="4314"
                           gloss="with"
                           domain="089020"
                           ln="89.112"
                           morph="PREP"
                           unicode="πρὸς">πρὸς</w>
                        <wg class="np"
                            xml:id="n430010010110020"
                            articular="true"
                            head="true"
                            rule="DetNP">
                            <w ref="JHN 1:1!11"
                               after=" "
                               class="det"
                               xml:id="n43001001011"
                               lemma="ὁ"
                               normalized="τόν"
                               strong="3588"
                               number="singular"
                               gender="masculine"
                               case="accusative"
                               gloss="-"
                               domain="092004"
                               ln="92.24"
                               morph="T-ASM"
                               unicode="τὸν">τὸν</w>
                            <wg class="np" xml:id="n430010010120011" head="true" rule="N2NP">
                                <w ref="JHN 1:1!12"
                                   after=","
                                   class="noun"
                                   type="common"
                                   xml:id="n43001001012"
                                   lemma="θεός"
                                   normalized="Θεόν"
                                   strong="2316"
                                   number="singular"
                                   gender="masculine"
                                   case="accusative"
                                   head="true"
                                   gloss="God"
                                   domain="012001"
                                   ln="12.1"
                                   morph="N-ASM"
                                   unicode="Θεόν,">Θεόν</w>
                            </wg>
                        </wg>
                    </wg>
                </wg>
                <w ref="JHN 1:1!13"
                   after=" "
                   class="conj"
                   xml:id="n43001001013"
                   lemma="καί"
                   normalized="καί"
                   strong="2532"
                   gloss="and"
                   domain="089017"
                   ln="89.92"
                   morph="CONJ"
                   unicode="καὶ">καὶ</w>
                <wg class="cl" xml:id="n430010010140040" rule="P-VC-S"><!--local:clause(), else-->
                    <wg role="p"
                        class="np"
                        xml:id="n430010010140011"
                        head="true"
                        rule="N2NP"><!--Role created from  Np2P-->
                        <w ref="JHN 1:1!14"
                           after=" "
                           class="noun"
                           type="common"
                           xml:id="n43001001014"
                           lemma="θεός"
                           normalized="Θεός"
                           strong="2316"
                           number="singular"
                           gender="masculine"
                           case="nominative"
                           head="true"
                           gloss="God"
                           domain="012001"
                           ln="12.1"
                           morph="N-NSM"
                           unicode="Θεὸς">Θεὸς</w>
                    </wg>
                    <wg role="vc" class="vp" xml:id="n430010010150011" rule="V2VP"><!--Role created from  vp2VC-->
                        <w ref="JHN 1:1!15"
                           after=" "
                           class="verb"
                           xml:id="n43001001015"
                           lemma="εἰμί"
                           normalized="ἦν"
                           strong="1510"
                           number="singular"
                           person="third"
                           tense="imperfect"
                           voice="active"
                           mood="indicative"
                           gloss="was"
                           domain="058010"
                           ln="58.67"
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                           unicode="ἦν">ἦν</w>
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                    <wg role="s"
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                        rule="DetNP"><!--Role created from  Np2S-->
                        <w ref="JHN 1:1!16"
                           after=" "
                           class="det"
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                               lemma="λόγος"
                               normalized="Λόγος"
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                               gloss="Word"
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                               morph="N-NSM"
                               unicode="Λόγος.">Λόγος</w>
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                    </wg>
                </wg>
            </wg>
        </wg>
    </sentence>



On Thu, Nov 17, 2022 at 8:36 AM Martin Honnen <martin.honnen@gmx.de> wrote:

Am 11/17/2022 um 2:29 PM schrieb Giuseppe G. A. Celano:
>
>
> it is:
>
> declare option output:method 'xml';
> declare option output:indent 'yes’;
>
> doc(“myfile.xml”)
>
>

How/where are you running that code? In the BaseX GUI? There I get an
indented output with similar code.